流體的過濾機理主要有2種，一種是基于顆粒的大小來分離，例如攔截、篩分和表面捕獲等;另一種是吸附，即顆粒在化學/電荷作用下粘附在濾器上。這就要求各個藥廠根據自身的實際需要來選擇不同的藍式過濾器。與流體的特性有關。例如，流體的粘度和化學/離 子成分，流體的粘度越大在同樣的壓力條件下流速越慢，流體與膜之間有較多接觸，過濾效果較好;再如，流體和膜的混合/接觸時間對過濾效果也有較大影響，混合/接觸時間越長則過濾效果越好。此外，需要注意的是，流體的特性只影響膜對流體的吸附截留效果而不影響顆粒大小的排除。與實際操作條件有關，如顆粒的流速和過濾壓力。要想取得好的過濾效果，一般選擇較低的流速，流速越 低截留效果越好。
過濾器一般分為藍式過濾器、精密過濾器和管道過濾器3種。藍式過濾器的纖維時有脫落，不能給出一個確切的孔徑，厚度一般在3～20mm，通常有吸附作用，并有較大的承污能力;精密過濾器的纖維一般用熱粘合或膜涂布而成，可以給出額定孔徑，比較薄(<1 mm)，吸附能力較小;管道過濾器的主要特點是質地堅硬，不易破碎，有曲折的通道和 非常高的內表面積，有一定的開孔率，能做完整性測試，常用于深級過濾，如Y型過濾器。
實踐證明藍式過濾器的結構移動對過濾是不利的，一旦膜的結構在過濾過程中發生了變化，則顆粒和纖維就能從Y型過濾器析出，影響到過濾效果。但是，速度/壓差僅對吸附截留有重要影響，對大小排除影響相當小。顆粒類型與過濾效果也有很大關系，顆粒分為可變 形顆粒和不可變形顆粒2種。在一定的壓力下，可變形顆粒會進入管道內并導致更多的過濾網孔堵塞，從而影 響到過濾效果，如凝膠的過濾。然而，不可變顆粒過濾時則會在濾膜上形成一層類似餅狀的物體。
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